当前位置: 本站首页 > 期刊在线 > 期刊总目 > 正文

基于GEO数据挖掘分析肝硬化-肝癌的演变机制

【来源:《华夏医学》编辑部 | 作者:陈燕等 | 编辑:李佳睿 | 发布日期:2023-02-20】

陈燕1 刘军2 莫之婧1

1. yL23411永利官网登录广西高校生物化学与分子生物学重点实验室 2. 桂林优利特医疗电子有限公司

摘要:目的:应用生物信息学方法挖掘肝硬化-肝癌演变的关键基因,并探究其机制。方法:使用GEO2R,从数据集GSE6764中筛选出在肝硬化组织和极早期肝癌组织中差异表达的基因,随后进行GO和KEGG分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用网络后通过Cytoscape软件中的MCODE插件检测网络中最显著模块所含关键基因;对关键基因进行聚类分析和预后分析。结果:共筛选出169个差异表达基因,其中表达上调和下调的基因数目分别为19个和150个。MCODE筛选后获得16个关键基因,主要与细胞因子和免疫等因素相关,其中关键基因MPEG1与肝癌患者无病生存期相关。结论:本研究发现的关键基因,有助于认识肝硬化-肝癌的演变机制,并可作为早期肝癌防治的潜在标志物。

关键词:肝硬化;肝癌;生物信息学;

DOI:10.19296/j.cnki.1008-2409.2022-06-001

PDF下载:点击下载


版权所有:华夏医学(Acta Medicinae Sinica)  联系电话:0773-2805467  电子邮箱:huaxia@glmc.edu.cn  地址:广西桂林市临桂区致远路1号yL23411永利官网登录明德楼316  (541199)