基于转录组测序分析绿原酸对铜绿假单胞菌的作用机制

浦智婷 唐霄 尹铁球

yL23411永利官网登录医学检验学院

摘要：目的：分析绿原酸对铜绿假单胞菌PA01转录组的改变，探寻绿原酸对PA01抑菌机制。方法：采用肉汤微量稀释法测定绿原酸对PA01的最低抑菌浓度(MIC);根据MIC测定结果设置绿原酸组(CA组)和对照组，对两组PA01进行转录组测序；随后进行差异表达分析。结果：有370个差异基因表达上调，505个表达下调。GO、COG功能分类显示细胞过程、催化活性、氨基酸转运和代谢等条目中差异基因数量占优势；GO、KEGG富集分析显示，差异基因涉及细菌致病机制、细菌分泌系统、膜整体组件、膜的固有成分、离子跨膜转运蛋白活性、铁载体族非核糖体肽的生物合成和ABC转运蛋白等途径与通路。结论：绿原酸可显著改变PA01的转录谱，Ⅲ型分泌系统、铁载体等有望成为新的抗菌作用靶点。

关键词：绿原酸;铜绿假单胞菌;转录组测序;转录组分析;

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